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宁波大学首次正式发表国际首个竹蛏科(缢蛏)基因组参考图谱

      缢蛏俗称蛏子,软体动物门、双壳纲、真瓣鳃目、竹蛏科,广泛分布在太平洋西部沿海,包括我国、朝鲜和日本等国沿海的潮间带区域。缢蛏营养丰富、味道鲜美,作为我国四大养殖经济贝类(蛤、蛏、蚶、蛎)、世界上五大养殖海洋软体动物之一,在海水养殖业中占有举足轻重的地位。2016年世界缢蛏总产量超过82万吨,价值约13亿美元;而我国在2017年缢蛏总产量即超过86万吨,其中浙江省缢蛏养殖产量达30.55万吨,居全国首位。本世纪初,以宁波大学为代表的浙江省贝类苗种繁育团队,在完成缢蛏幼体饵料营养选择性研究基础上,率先攻克缢蛏的人工育苗技术,使得缢蛏成为浙江省乃至全国的重要养殖品种。

团队于2018年11月完成了基因组的组装、功能注释和相关文章初稿,并经过多次修改后于2018年12月31日首次投稿,经4位国际同行严格评议,又对数据库和相关内容进行多达5次修改完善,相关学术论文“Chromosomal-level genome assembly of the razor clamSinonovacula constricta(Lamarck, 1818)”最后于2019年8月6日被Molecular Ecology Resources正式接收,国际同行严格把关后的高质量缢蛏基因组数据也于2019年8月5日在国际上首次在NCBI网站释放供同行使用(登记号PRJNA508451),由此项目历经3年得以圆满完成。审稿专家对本论文给予了高度评价,认为该缢蛏基因组测序和组装的方法和策略合理、完善,首次将“Purge haplotigs”软件应用到软体动物基因组测序分析中,可更好展示这种方法在高杂合物种中的作用,对研究高杂合物种(如软体动物)的进化和生物学特征具有重要的指导和借鉴意义。

全文链接:Chromosome-level genome assembly of the razor clamSinonovaculaconstricta (Lamarck, 1818)。https://doi.org/10.1111/1755-0998.13086



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